Praktika, Studentische Hilfskräfte und Abschlussarbeiten

Die Tätigkeit erfolgt begleitend zu einem Projekt, das eine neue Methode zur Optimierung von Flotationsprozessen (zur Aufbereitung mineralischer Rohstoffe) validieren wird. Während von technischer Seite an der Validierung gearbeitet wird, betreibt die wissenschaftliche Hilfskraft eine Akquise kommerzieller Partnereinrichtungen. Bei der Akquise wird die Kommunikation mit den Partnereinrichtungen dokumentiert. Die dokumentierte Kommunikation soll dann später bei der Entwicklung eines Geschäftsmodells berücksichtigt werden. Das Geschäftsmodell wird weiterhin eng mit dem technisch-wissenschaftlichen Personal des HiFs abgestimmt und erfolgt zusammen mit der Abteilung für Technologietransfer des HZDR.

Voraussetzung ist eine Graduierung auf Niveaus eines Bachelors oder eines Vordiploms. Interessent:innen, die gerade eine Bachelorarbeit oder ein Vordiplom abschließen, sind ebenfalls willkommen sich zu bewerben.

Der Dienstort kann wahlweise in Dresden-Rossendorf oder in Freiberg sein. Vereinzelte Reisen nach Freiberg sind allerdings erwünscht und die Bereitschaft zur Arbeit in Freiberg wird positiv bewertet. Die Möglichkeit zu der mobilen Arbeit bzw. der Arbeit im Homeoffice ist ausdrücklich gegeben.

Die Anwendung der Phage Surface Display (PSD) -Technologie hat die Entwicklungen auf dem Gebiet der biomolekularen Sensoren und der Materialwissenschaft beschleunigt. Eine praktische Ergänzung zu dieser Technologie ist Next-Generation Sequencing (NGS). In dieser Kombination wird eine umfassendere Betrachtung von Biopanning-Runden mit einem tiefen Einblick in den gesamten Sequenzraum ermöglicht. Es ist möglich, Sequenzierungsartefakte zu identifizieren, Sequenzanzahl und -struktur zu bestimmen, Bindungsmotive zu erkennen und die Entwicklung der Phagenbibliothek im Laufe eines Experiments zu beobachten. PSD in Kombination mit Biopanning ist in der Lage, aus großen Peptidbibliotheken Kandidaten mit hoher Affinität und Selektivität zu den gewünschten Substraten auszuwählen. In der Praxis führt diese spezifische Anreicherung von Peptiden zu einer Verringerung der Bibliotheksvielfalt. Es sollte daher möglich sein diese Reduzierung des Sequenzraums mit Hilfe von Data Clustering Methoden besser darstellen zu können um Distanzen zwischen ähnlichen Sequenzfamilien besser zu verstehen.

Vorrausetzung ist eine gültige Immatrikulation in einem Masterstudium der Bioinformatik, Biotechnologie, Molekularbiologie, Biochemie, Biologie oder einem verwandten naturwissenschaftlichen Studiengang. Weiterhin:

- Interesse in Data Cluster Methoden und der Bioinformatik
- Grundkenntnisse in Bioinformatik, Statistik, Stochastik und Clustering
- Erfahrung mit einer Programmiersprache (z. B. Python, R, C, C++ oder Andere)
- Selbstständige Arbeitsweise und Teamfähigkeit
Interessierte Studierende werden gebeten, ihre Bewerbungsunterlagen inklusive Lebenslauf, letztes Studienzeugnis und Motivationsschreiben einzureichen.

Das Thema ist im Rahmen einer Master- Diplomarbeit in Verbindung mit einem Pflichtpraktikum zu bearbeiten. Daraus ergibt sich eine Laufzeit von 12 Monaten. Eine Verlängerung oder Anpassung der Laufzeit kann in Absprache mit dem Betreuer erfolgen. Wir können dir bieten:

- Ein innovatives multidisziplinäres Forschungsumfeld mit Bezug zu relevanten Fragestellungen in der Ressourcentechnologie
- Betreuung durch erfahrene Wissenschaftlerinnen und Wissenschaftler
- Praxisnahe Erfahrungen im Bereich der Bioinformatik und Directed Evolution